按照中央财经领导小组办公室的要求，国务院发展研究中心课题组对来自不同城市的1539家不同行业、不同规模和不同所有制的企业进行了实地调研和问卷调查，经过统计分析，在全部9项改革任务重，企业最关注的问题依次为：完善市场体系、理顺政企关系和转变政府职能、深化国有企业改革、支持非公经济发展、加快财税体制改革、推进金融体制改革、完善劳动就业与社会保障体系、建立有利于企业创新的体制和政策环境、进化对外开放。
完善市场体系的政策建议：一是改革要素市场；二是改革资源、能源价格和垄断行业；三是改革市场监管制度；四是改善社会信用环境。
理顺政企关系和转变政府职能的政策建议：一是改革行政审批制度；二是消除政府的所有制、规模和地域歧视；三是转变政府职能；四是提升政府诚信度；五是避免政府过度干预；六是破除地方保护。
深化国有企业改革的政策建议：一是政府高层坚定改革决心，相关部门加强理论研究和社会宣传，逐步形成社会各方的改革共识，稳步推进国有经济改革；二是以国有资产管理体制改革和国有垄断行业改革作为下一步国有经济改革的两大突破口；三是明确时间表，尽快完成国有企业改革的历史遗留问题。
支持非公有制经济发展的政策建议：一是进一步改善非公经济发展环境；二是维护政府信用，政策不能朝令夕改。
加快财税体制改革与推进金融体制改革的政策建议：一是降低总体税负；二是以“完善政府采购规则，加大创新、节能环保产品的支持”为重点使财政政策更有效地引导和支持企业发展；三是金融体制改革应以坚持市场化方向和提升服务实体经济能力为出发点。
完善劳动就业与社会保障体系的政策建议：一是完善就业服务体系；二是完善《劳动合同法》；三是完善非户籍劳工的城市公共服务；四是完善社会保障缴费比例及基数标准。
建立有利于企业创新的体制和政策环境的政策建议：一是建立“一个公平竞争的创新环境”；二是改革和完善科技创新的评价体系。
进一步深化对外开放的政策建议：一是鼓励和支持企业对外投资；二是坚持和扩大对外开放政策；三是深化外贸政策的改革。
